Отсутствие прямого очного общения между обучающимся и преподавателем.
Необходимость в персональном компьютере и доступе в Интернет и поддержания постоянного доступа к источникам информации.
Наличие техническая оснащенность, высокие требования к администрированию процесса обучения, сложность мотивации слушателей.
Проблема аутентификации пользователя при проверке знаний. Поскольку до сих пор не предложено оптимальных технологических решений, большинство дистанционных программ по-прежнему предполагает очную экзаменационную сессию, либо установку видеокамер на стороне обучающего и соответствующего программного обеспечения.
Необходимость наличия целого ряда индивидуально-психологических условий - жесткая самодисциплина, недостаток практических занятий, отсутствует постоянный контроль над обучающимися, который для российского человека является мощным побудительным стимулом.
Высокая стоимость моделирования интеллектуальной интерактивной среды дистанционного обучения, на начальном этапе, велики расходы на создание системы самих курсов дистанционного обучения, велики затраты на покупку технического обеспечения.
Высокая трудоемкость разработки курсов дистанционного обучения. Создание 1 часа действительно интерактивного мультимедийного взаимодействия занимает более 1000 часов профессионалов. Один из путей решения этой проблемы это поиск и использования существующих видео и аудио файлов, использование методов постепенного усложнения дистанционных курсов.
Недостаточная компьютерная грамотность, отсутствие опыта дистанционного обучения.
Слабое использование стандартов в дистанционном обучении, несовершенство стандартов затрудняет повторное использование, обмен, многократное использование, совместимость учебных материалов.
Проблема поиска специалистов, требуется высокая квалификация разработчиков, для создания качественных мультимедийных курсов нужна команда из специалиста предметной области, художника, программиста и т. д.
Для повышения эффективности методов дистанционного обучения необходимо дальнейшее совершенствование курсов, создания мультимедийных озвученные видео и слайд-фильмов, анимации, графика, насыщенной интерактивности, системы математического моделирования процессов и явлений. Использование учебного материала, который, благодаря мультимедиа легко усваивается, увеличения разнообразных контрольных и тестовых заданий, возможности общения слушателей между собой. Тщательное и детальное планирование деятельности обучаемого, её организации; четкой постановка задач и целей обучения, повышение степени интерактивности электронных учебников, обеспечение обратной связи с помощью видеоконференцсвязи. Использование разных видов деятельности таких, как дебаты, голосование, размышление и критика. Структура курса должна быть модульной. Необходимость наличия механизма оказания студентам помощи в разрешении технологических проблем при использовании технического оборудования; использование сайтовых помощников, являющихся фактически «ушами и глазами» преподавателей в сайтах и оказывающих реальную помощь в установление интерактивной связи между преподавателями и студентами и студентов между собой. Создания виртуальной системы переговоров, обеспечивающей отсутствие языкового барьера, использование метода «погружения» в язык. При дистанционном обучении учебный материал, задания, инструкции должны быть разработаны более тщательно, чем это обычно делается в очном обучении.

Моделирование интеллектуальных интерактивных сред дистанционного образования требует совместное участия преподавателей, специалистов по разработке учебного материала и использованию различных технологий, экспертов, редакторов, администраторов, технического персонала и прочих специалистов.
Стоимость создания одного такого кypca за рубежом - от 30 ООО до 70 ООО, в России - от 30 ООО руб. до 70 ООО руб., хотя некоторые российские курсы по многим показателям не только не уступают, но и превосходят зарубежные аналоги.